Com a criação no início dos anos 90 das duas associações, a ACPA e a ANCPA, e passando a ser estas a gerirem o Livro Genealógico da raça, foi implementado um programa de conservação e melhoramento genético que tem desde então como objetivos preservar a raça, a variabilidade que esta apresenta e o seu melhoramento genético no sentido da melhor valorização dos animais da raça.
Atualmente a gestão do Livro Genealógico está a cargo do ACEPA, A.C.E. – Agrupamento Complementar de Empresas do Porco Alentejano sendo a execução do programa de conservação e melhoramento genético partilhada pelas duas associações de criadores. O Livro Genealógico tem no presente cerca de 6.000 porcas reprodutoras e 450 varrascos em 164 criadores ativos, estendendo-se pelas regiões da Beira Baixa, Ribatejo, Alentejo até à Serra Algarvia. Estando a raça Porco Alentejano classificada como ameaçada de extinção.